发起人地区的方向性
Yi Jin1, Umut Eser2, Kevin Struhl1
1Department of Biological Chemistry and Molecular Pharmacology, Harvard Medical School, Boston, MA 02115, USA.
细胞促进区本质上是双向的,转录的分歧往往是机械的特征,而不是功能性的. 进化塑造了这些区域,有利于编码RNA产生的非编码反意义RNA.
科学领域:
- 遗传学
- 分子生物学
- 进化生物学
背景情况:
- 在真核中,促进子区域往往表现出不同的转录.
- 通过分离转录产生的反意义RNA的生物学意义尚不清楚.
- 目前尚不清楚分离转录是RNA聚合酶II (Pol II) 转录的功能结果还是机制副产品.
研究的目的:
- 来自真核促进体区域的分离转录的功能意义.
- 确定反意义RNA是否是一种机械副产品或具有生物意义.
- 探索促销者定向的演化形态.
主要方法:
- 使用新生转录映射的功能性进化方法.
- 含有外来酵母DNA的S. cerevisiae菌株的分析
- 在本地与外来DNA环境和新进化的人类增强剂/促进剂中对转录方向性的比较.
主要成果:
- 当被放置在外来DNA环境中时,促进区域会失去原生方向性.
- 外来DNA中的偶然促进子区域表现出相同的双向转录,这表明有机械基础.
- 新进化的人类增强剂和促进器区域显示出双向性.
- 进化过程可以为新功能清除或保留双向促进器.
结论:
- 细胞的促进区域本质上是双向的.
- 分离转录是转录启动的一个机制特征.
- 进化压力塑造了促销器区域,使转录偏向编码RNA.
- 反意义RNA可能是这种内在双向性的副产品.
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