功能性基因组学的可逆的鼠标胚胎干细胞生物库资源

科学领域:

• 遗传学
• 干细胞生物学
• 分子生物学

背景情况:

• 功能性基因组学研究是必不可少的,但经常受到细胞群中的克隆变异的阻碍.
• 由于固有的细胞异质性,生物研究中的可复制性是一个重大挑战.

研究的目的:

• 建立一个完整的基因组功能注释资源.
• 开发一种克服高通量基因选的克隆变异的方法.
• 确定涉及至关重要的细胞过程,血管生成和病毒感染的新基因.

主要方法:

• 用基因组和突变生成超过10万个鼠标胚胎干细胞 (mES) 的生物库.
• 每个细胞系都有基因编码,条件和可逆突变, 针对16970个基因.
• 使用可逆性突变来实现姐妹细胞的直接功能注释,减轻克隆变异.

主要成果:

• 创建了Haplobank,这是一个基因突变mES细胞的资源,并提供给研究人员.
• 使用Haplobank的逆转基因查发现了调节mES细胞的重要过程的基因,生长血管生成和血管系谱的特征.
• 全基因组前检测发现PLA2G16是犀利病毒诱导细胞毒性的关键宿主因子.

结论:

• 哈普基因组与可逆变异技术相结合,为高吞吐量和可重复的功能性基因组注释提供了一个强大的平台.
• 这种资源显著提升了发现基因功能及其对各种生物表型的贡献的能力.
• 这项研究强调了哈普洛银行在发现基本生物过程和疾病机制中所涉及的基因的有用性.