关联分析发现65个新的乳腺癌风险位点
Kyriaki Michailidou1,2, Sara Lindström3,4, Joe Dennis1
1Centre for Cancer Genetic Epidemiology, Department of Public Health and Primary Care, University of Cambridge, Cambridge, UK.
这项研究通过一项大型全基因组关联研究确定了65个与乳腺癌风险相关的新基因位点. 这些发现有助于我们更好地了解遗传易感性,
科学领域:
- 遗传学
- 癌症学
- 基因组学
背景情况:
- 乳腺癌风险受到罕见和常见的遗传变异的影响, 但遗传贡献的很大一部分仍然无法解释.
- 现有的知识主要集中在编码变体 (例如BRCA1) 和常见的非编码变体上,在理解整体遗传易感性方面存在差距.
研究的目的:
- 通过大规模的全基因组关联研究 (GWAS) 确定与整体乳腺癌风险相关的新遗传位置.
- 调查已识别的风险位点的功能相关性,特别是它们的调控作用和乳腺瘤体质突变的重叠.
- 探索监管因素对乳腺癌遗传性的贡献,并确定丰富的监管特征.
主要方法:
- 进行了全基因组关联研究,包括超过122,977例乳腺癌病例和105,974例欧洲血统对照病例,以及14,068例和13,104例东亚血统对照病例.
- 在全基因组显著性值 (P < 5 × 10−8) 上使用统计分析来识别与乳腺癌风险相关的单核突变.
- 整合了基因数据以预测乳腺细胞中风险基因的基因,并将其与乳腺瘤中已知的体质驱动基因进行了比较. 分析了监管特征中的遗传性丰富性.
主要成果:
- 发现了65个与整体乳腺癌风险有显著关联的新位点.
- 大多数已识别的风险SNP位于偏远的调节元件中.
- 这些位点的预测目标基因与乳腺瘤中发现的体质驱动基因之间有显著的重叠.
- 发现乳腺癌的遗传性增强了调控特征,特别是某些转录因子结合点,比全基因组平均值高2-5倍.
结论:
- 这项研究显著扩大了已知影响乳腺癌风险的基因位置.
- 鉴定到的风险变异常常位于调控元素中,这表明基因调控在乳腺癌的发展中起着至关重要的作用.
- 这些发现提供了对乳腺癌遗传易感性的生物学机制的见解,并支持了用于查和预防的改进遗传风险预测模型的潜力.
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