活细胞表面的aptamer移位反应及其应用
Long Li1, Xigao Chen1, Cheng Cui1,2,3
1Department of Chemistry, Department of Physiology and Functional Genomics, UF Health Cancer Center, UF Genetics Institute , University of Florida , Gainesville , Florida 32611 , United States.
Journal of the American Chemical Society
|September 21, 2019
概括
本研究提出了使用DNA和蛋白质有效地从细胞表面移除aptamer的三种方法. 这些技术提高了阿普坦去除的速度和准确性,增强了基于细胞的测试.
科学领域:
- 生物化学
- 分子生物学
- 生物技术
背景情况:
- 在基于核酸的网络中,DNA链的移位至关重要,但在复杂的生物环境中却具有挑战性.
- 对生物分子具有很高的亲和力和选择性,将核酸与多种点连接起来.
- 需要有效地从细胞表面去除aptamer,以防止错误信号和改进测试.
研究的目的:
- 开发一种简单高效的方法来从活细胞表面移除aptamer.
- 在复杂的细胞环境中研究体移位的动力学.
- 在蛋白质检测和细胞选择等生物应用中展示aptamer移位的实用性.
主要方法:
- 开发了三种阿普坦移位方法:补充DNA (cDNA),脚标记cDNA (tcDNA) 和单链结合蛋白 (SSB).
- 研究了自然细胞膜上的DNA链位移的动力学.
- 评估了阿普坦去除的效率及其对下游应用的影响.
主要成果:
- 托霍尔德介导和SSB介导的位显著增强了反应动力学.
- 这些方法实现了快速和完整的aptamer去除,防止虚假信号的内化.
- 通过Aptamer排位,可以轻松检测翻译后的膜蛋白修饰,并提高细胞SELEX的效率.
结论:
- 开发了用于细胞表面的高效的阿普坦移位策略.
- 通过手指介导和SSB介导的增强动力学可以克服复杂细胞环境的挑战.
- 亚特位是提高基于细胞的生物测定和选择过程的准确性和效率的有价值的工具.


