使用现场测序对长距离神经元投射进行高通量映射
Xiaoyin Chen1, Yu-Chi Sun1, Huiqing Zhan1
1Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY 11724, USA.
Cell
|October 19, 2019
概括
研究人员开发了BARseq, 这是一种新的方法, 可以绘制成千上万个神经元的预测和它们在一只老鼠大脑中的基因表达. 这种技术有助于理解神经电路的组织和形成.
科学领域:
- 神经科学
- 分子生物学
- 遗传学
背景情况:
- 了解神经回路需要对多种细胞类型进行详细分析.
- 目前的方法难以实现单个神经元分辨率和细胞类型分析的高吞吐量.
研究的目的:
- 介绍BARseq (通过测序解析的条形解码解剖学),一种新的多重复合方法.
- 实现空间分辨的神经元及其投影的高通量映射.
- 将神经元投射与细胞特征联系起来,比如基因表达.
主要方法:
- 使用RNA条形码进行多重分析.
- 应用BARseq来绘制小鼠听觉皮层中数千个神经元的投影.
- 在单细胞分辨率上整合了解剖学和转录学数据.
主要成果:
- 确认主要投射神经元类 (IT,PT类,CT) 的层状组织.
- 确定了一种特定于转录定义的IT神经元亚型的新投影类型.
- 在11个大脑区域成功地映射了3579个神经元.
结论:
- BARseq将解剖学和转录学方法用于高吞吐量细胞分析.
- 这种方法可以揭示神经电路结构和形成的组织原理.
- 有助于更深入地了解神经电路的复杂性和细胞类型的相互作用.
