血液和组织的微生物组分析表明癌症的诊断方法

科学领域:

• 癌症学
• 微生物组研究
• 基因组学

背景情况:

• 新出现的证据表明微生物在癌症的发展和进展中起着作用.
• 癌症基因组图谱 (TCGA) 为研究癌症相关微生物群落提供了宝贵的资源.
• 了解癌症微生物组为新的诊断策略提供了潜力.

研究的目的:

• 使用TCGA数据系统地描述各种癌症类型的微生物特征.
• 评估血液中的微生物核酸用于癌症检测的诊断潜力.
• 评估基于微生物组的瘤诊断工具的可行性.

主要方法:

• 从33种未经治疗的癌症样本中分析全基因组和全转录组测序数据.
• 在瘤组织和患者血液中识别和描述微生物.
• 使用严格的净化方法来确保数据的准确性.
• 在早期癌症和无细胞瘤DNA平台上验证基于血液的微生物特征.
• 使用血衍生微生物核酸对健康个体和癌症患者进行歧视.

主要成果:

• 在大多数主要癌症类型中的组织和血液样本中发现了独特的微生物特征.
• 在早期癌症 (Ia-IIc) 和缺乏可检测的基因组变异的癌症中,基于血液的微生物特征具有预测价值.
• 即使在进行了广泛的清除 (删除了高达92.3%的数据),签名仍然具有预测性.
• 血衍生微生物核酸使健康个体与前列腺癌,肺癌和黑色素瘤患者之间有区别.

结论:

• 癌症微生物组包含具有显著诊断潜力的独特特征.
• 血液中的微生物核酸是癌症检测的有希望的非侵入性生物标志物.
• 对基于微生物组的瘤诊断进行进一步的研究是有必要的,以探索其临床实用性.