使用血蛋白学和单细胞转录组学优先考虑心肌梗塞后心力衰竭的候选患者
Mark Y Chan1,2, Motakis Efthymios1,3, Sock Hwee Tan1
1Department of Medicine, Yong Loo-Lin School of Medicine, National University of Singapore (M.Y.C., M.E., S.H.T., C.L.D., L.H.L., W.-M.S., J.P.L., C.-H.L., R.S.Y.F., M.A.A.-J., A.M.R.).
Circulation
|September 5, 2020
概括
这项研究确定了与心肌梗塞 (MI) 后心力衰竭 (HF) 相关的关键血蛋白及其基因表达. 这些发现突出了潜在的新生物标志物和药物点,用于MI后的HF治疗.
科学领域:
- 心血管生物学
- 蛋白质组学
- 基因组学
背景情况:
- 心脏衰竭是急性心肌梗塞 (MI) 后的一个主要并发症.
- 识别与MI后HF相关的血蛋白和基因表达模式对于发现新的生物标志物和治疗点至关重要.
研究的目的:
- 鉴定与心肌梗塞后心力衰竭相关的血蛋白及其基因表达.
- 发现新的生物标志物和潜在的药物标.
主要方法:
- 在两个独立的队列 (CDCS和IMMACULATE) 中使用基于Aptamer的血蛋白质测量1305个MI后的蛋白质.
- 用权重基因共表达网络分析和机器学习来识别与HF和左心室射出小部分相关的蛋白质.
- 蛋白质与来自小鼠和人类HF模型的单细胞心脏转录组进行了交叉引用.
主要成果:
- 在CDCS队列中,有212种差异表达的血蛋白与随后的HF事件相关.
- 分析发现36个与MI后HF相关的血蛋白质,其中15个来自转录组的基因蛋白候选蛋白质.
- 发现的关键蛋白质包括已知生物标记物 (NT-proBNP,Troponin T) 和新型候选物 (angiopoietin- 2, thrombospondin- 2).
结论:
- 大规模的血蛋白质组与单细胞心脏转录组相结合,有效地优先考虑了MI后HF的蛋白质候选物.
- 这项研究确定了新的蛋白质生物标志物和潜在的治疗点,用于治疗心肌梗塞后的心力衰竭.
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