肠道器官再生的表型景观
Ilya Lukonin1,2, Denise Serra1,2, Ludivine Challet Meylan1
1Friedrich Miescher Institute for Biomedical Research (FMI), Basel, Switzerland.
Nature
|October 8, 2020
概括
研究人员发现肠道干细胞如何使用器官再生组织. 他们确定视网膜酸信号是控制细胞命运和改善肠道再生的关键.
科学领域:
- 干细胞生物学
- 胃肠病学
- 发育生物学
背景情况:
- 肠道器官模拟成年干细胞的肠道上皮的再生能力.
- 了解控制器官形成和组织再生的机制至关重要.
研究的目的:
- 解开导致肠道有机体形成和再生的分子机制.
- 确定关键的调节基因和涉及肠干细胞行为和分化的途径.
主要方法:
- 使用基于图像的注释化合物库来测试器官形成和再生.
- 为数十万种有机体生成多变体特征资料,以量化描述它们的表型景观.
- 采用表型指纹来推断新兴系统中的调节性遗传相互作用和遗传相互作用,并与RNA测序相结合.
主要成果:
- 确定了调节细胞命运过渡和再生与平衡的基因.
- 发现了以前未知的途径,特别是视网膜酸信号.
- 视网膜酸核受体在控制退出再生状态和促进肠细胞分化方面的关键作用.
- 证明了内源性视网酸代谢在细胞命运过渡的转录程序启动中的作用.
结论:
- 特别是通过核受体进行的视网酸信号传递对于调节肠干细胞从再生状态退出以及随后的肠细胞分化至关重要.
- 这项研究建立了一种新的方法来绘制新兴系统中的基因相互作用,使用器官类型特征.
- 一种视网膜X受体抑制剂被确定为增强肠道再生的潜在治疗剂.
