一个单细胞RNA测序的人类肺部的分子细胞图谱
Kyle J Travaglini1,2, Ahmad N Nabhan1,2,3, Lolita Penland4,5
1Department of Biochemistry, Howard Hughes Medical Institute, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA, USA.
Nature
|November 19, 2020
概括
研究人员使用单细胞RNA测序创建了一个全面的人类肺细胞图谱. 这本地图描绘了58种细胞类型, 揭示了它们的功能, 相互作用以及在疾病和进化中的作用.
科学领域:
- 基因组学
- 细胞生物学
- 人体解剖学
背景情况:
- 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 已经生成了细胞表达特征,但缺乏对全器官图谱的系统识别和定位.
- 创建单个器官的完整分子细胞地图仍然是一个挑战.
研究的目的:
- 构建一个广泛的分子细胞图谱.
- 系统地识别和定位人类肺部内的所有分子细胞类型.
主要方法:
- 在大约75,000个人类肺和血液细胞中利用滴状和板状单细胞RNA测序.
- 采用多端单元注释方法进行综合分析.
主要成果:
- 确定了人类肺部58个不同的细胞群的基因表达特征和解剖位置.
- 确定了41种已知和14种以前未知的细胞类型.
- 描述细胞功能,确定转录因子/标记物,预测信号相互作用,并确定受疾病基因和病毒影响的细胞类型.
结论:
- 人类肺细胞图谱为了解细胞身份,功能和发展,疾病和进化中的相互作用提供了分子基础.
- 用小鼠数据进行比较分析显示了肺细胞类型和基因表达可塑性的进化变化.
