在细胞环境中识别多个具有广泛序列耐受性的G-四重体相关蛋白质
Haomiao Su, Jinglei Xu, Yuqi Chen
1Britton Chance Center for Biomedical Photonics, Wuhan National Laboratory for Optoelectronics-Huazhong University of Science and Technology, Wuhan, Hubei 430074, China.
Journal of the American Chemical Society
|January 20, 2021
概括
研究人员开发了一种新的体内方法,使用G4联体介导的交叉链接来识别与G四重复 (G4) 相关的蛋白质 (G4RP). 这种方法在细胞中发现了许多G4RPs,进步了生物学中G4功能的研究.
科学领域:
- 分子生物学
- 遗传学
- 生物化学
背景情况:
- G四重复 (G4) 结构是具有重要的生物作用的非正规核酸构成.
- 识别G四重复相关蛋白 (G4RPs) 对于理解G4功能至关重要.
- 现有的G4RP识别方法包括工艺特异性发现和体外拉下测试.
研究的目的:
- 开发一种新的体内策略来识别具有广泛序列耐受性的G4RP.
- 应用新的方法来识别人类细胞系中的G4RPs.
- 使用补充实验技术验证发现.
主要方法:
- 使用G4联体介导的交叉链接的体内策略的开发.
- 该方法应用于SV589和MM231细胞系.
- 通过电泳运动转移试验 (EMSA) 和增强交叉连接和免疫沉 (eCLIP) 进行验证.
主要成果:
- 在SV589细胞中发现114个G4RP,在MM231细胞中发现281个G4RP.
- 已识别的蛋白质与现有的拉下测试文献成功重叠.
- 通过eCLIP确认SERBP1是一种新的与G4相互作用的G4结合蛋白.
结论:
- 开发的G4联体介导交联方法是G4RP鉴定的有效体内策略.
- 这种方法提供了广泛的序列容忍,并补充了现有的方法.
- 这些发现为G4蛋白相互作用及其生物学意义提供了新的见解.


