通过MERFISH对小鼠原发动性皮层进行空间解析的细胞图谱
Meng Zhang1,2,3, Stephen W Eichhorn1,2,3, Brian Zingg4,5
1Howard Hughes Medical Institute, Harvard University, Cambridge, MA, USA.
Nature
|October 7, 2021
概括
研究人员使用多重错误强的现场化 (MERFISH) 绘制了小鼠大脑的主要运动皮质. 这揭示了95种细胞类型及其空间组织,
科学领域:
- 神经科学
- 基因组学
- 空间生物学
背景情况:
- 哺乳动物的大脑具有多种细胞类型, 组织成复杂的神经回路.
- 单细胞RNA测序可以识别细胞类型,但失去了空间信息.
- 了解细胞对大脑功能的贡献需要空间和连接数据.
研究的目的:
- 创建小鼠主要运动皮层的分子定义和空间解析的细胞图谱.
- 研究神经元和非神经元细胞类型的空间组织和连接性.
主要方法:
- 复合错误强的现场化 (MERFISH) 用于单细胞转录组成像.
- 在小鼠主要运动皮质和相邻区域中分析了大约30万个细胞.
- 整合MERFISH与逆行标记以绘制神经元投影.
主要成果:
- 识别了95个不同的神经元和非神经元细胞群.
- 在激发性和抑制性神经元中发现了层状组织.
- 在皮层深度轴上表现出持续的基因表达梯度.
- 发现了一个复杂的投影网络, 细胞集群的目标是多个区域,
结论:
- MERFISH提供了一个强大的工具来生成高分辨率的空间细胞地图.
- 鼠标的主要运动皮层表现出复杂的空间组织和连接模式.
- 详细地绘制细胞类型及其连接对于理解大脑功能至关重要.
