激活CRISPR和干扰幕解码原始人类T细胞的刺激反应
Ralf Schmidt1,2, Zachary Steinhart1,2, Madeline Layeghi1
1Gladstone-UCSF Institute of Genomic Immunology, San Francisco, CA 94158, USA.
Science (New York, N.Y.)
|February 3, 2022
概括
研究人员在人类T细胞中使用CRISPR屏检测控制细胞因子的基因. 这一发现可能会为癌症和自身免疫性疾病提供新的免疫疗法.
科学领域:
- 免疫学
- 分子生物学
- 遗传学
背景情况:
- 在T细胞中调节细胞因子的产生对免疫反应至关重要.
- 对T细胞细胞因子的失调与自身免疫,免疫缺陷和癌症有关.
- 在人类T细胞中发现细胞因子调节剂是具有挑战性的.
研究的目的:
- 系统地识别控制人体T细胞中白蛋白-2 (IL-2) 和干扰素- (IFN-γ) 生产的基因网络.
- 在人类T细胞中开发和应用全基因组CRISPR激活 (CRISPRa) 和干扰 (CRISPRi) 选方法.
- 揭示基因干扰如何影响T细胞激活和细胞因子.
主要方法:
- 在人类T细胞中进行了全基因组CRISPR激活 (CRISPRa) 和CRISPR干扰 (CRISPRi) 查.
- 用阵列式的CRISPRa幕进行了命中确认和多重分泌体表征.
- 单细胞RNA测序与CRISPR查相结合,以深度确定基因的分子概况.
主要成果:
- 通过CRISPRa和CRISPRi查,成功发现了调节IL-2和IFN-γ的基因网络.
- 测试CRISPRa证实了关键调节剂,并显示了细胞因子分泌的变化.
- 单细胞RNA测序阐明了扰动调节T细胞状态和细胞因子表达的分子机制.
结论:
- 人类T细胞的全基因组CRISPR查对于发现细胞因子调节剂是有效的.
- 这些已识别的基因可以重新编程T细胞功能和细胞因子的产生.
- 这些发现为设计针对T细胞反应的新型免疫疗法提供了洞察力.
