多重基因编辑可用于真菌天然产品的基因组挖掘的组合表观遗传调节
Fanglong Zhao1, Chunxiao Sun1, Zhiwen Liu1
1Department of Chemical and Biomolecular Engineering, Rice University, Houston, Texas 77005, United States.
Journal of the American Chemical Society
|December 21, 2022
概括
研究人员开发了一种多重基因编辑 (MBE) 平台,用于高效地操纵真菌基因组. 这种工具通过激活Aspergillus nidulans中的神秘基因集群来发现新型天然产品 (NP).
科学领域:
- 合成生物学
- 自然产品的发现
- 菌类基因组学
背景情况:
- 细丝真菌中天然产品 (NP) 的基因组挖掘受到复杂的遗传调节的阻碍.
- 表观遗传修饰会影响真菌基因转录,但同时对多个基因进行操纵是有限的.
研究的目的:
- 开发一种高效,高吞吐量真菌基因组操纵的新平台.
- 能够激活神秘的基因集群以发现新的NP.
主要方法:
- 开发多重基因编辑 (MBE) 平台,可同时禁用多达8个基因.
- 应用MBE以组合性无活化三种负表观遗传调节剂在Aspergillus nidulans中.
- 用于识别新型NP的激活基因群的分析.
主要成果:
- 这一MBE平台表现出菌基因组操纵的高能力和吞吐量.
- 对表观遗传调节剂的组合性失活激活了八个神秘的基因集群.
- 识别具有独特的和聚胺混合化学支架的新型NP.
结论:
- 这种可扩展和高效的MBE平台显著推进了真菌基因组操纵.
- 这种方法有助于从丝状真菌中提取新型NP的基因组.
- 这种平台提供了利用真菌化学多样性的强大策略.


