多祖先全基因组协会对大动脉狭窄的研究在百万退伍军人计划中确定了多个新位点
Aeron M Small1,2, Gina M Peloso3,4, Jason Linefsky5,6
1Cardiovascular Medicine Division, Department of Medicine, Brigham and Women's Hospital (A.M.S., C.J.O.), Harvard Medical School, Boston, MA.
全基因组关联研究发现了六个新的基因组区域,用于常见的心脏病 - - 动脉狭窄 (CAS). 这些发现突显了CAS发育中的脂质代谢,炎症和脂肪以及其与心血管疾病的遗传联系.
科学领域:
- 遗传学和基因组学
- 心血管疾病研究
- 精准医学
背景情况:
- 动脉狭窄 (CAS) 是老年人中最常见的心脏膜疾病.
- 目前没有有效的预防治疗方法.
- 全基因组关联研究 (GWAS) 为确定影响CAS和潜在治疗点的遗传因素提供了一条途径.
研究的目的:
- 进行大规模的全基因组关联研究 (GWAS) 和对动脉狭窄 (CAS) 的基因关联分析.
- 在不同的祖先中确定CAS的新遗传风险位点.
- 研究CAS的遗传结构及其与动脉样硬化心血管疾病和心脏代谢风险因素的关系.
主要方法:
- 在14,451名CAS患者和398,944名来自百万退伍军人计划的对照中进行了全基因组关联研究 (GWAS).
- 在多个独立群体中重复发现,共计12889例和348,094例对照.
- 使用多基因优先分数,eQTL同位化和最近基因方法来优先考虑因果基因. 使用孟德尔随机化和全现象关联研究 (PheWAS) 来评估因果关系和变性.
主要成果:
- 在17个基因组区域中确定了23个全基因组显著的变异,在11个区域复制了14个变异.
- 发现了与CAS相关的6个新基因组区域,包括非白人个体特有的变异 (rs12740374在*CELSR2*,rs1522387在*SLMAP*).
- 孟德尔随机化涉及脂蛋白 (a) 和LDL胆固醇在CAS; *FTO*位点显示与CAS独立关联,即使调整了BMI.
结论:
- 一个多祖先GWAS发现了六个新的基因组区域,有助于动脉狭窄症 (CAS) 的易感性.
- 该研究强调了脂质代谢,炎症,细胞衰老和脂肪在CAS病理学中的作用.
- 澄清了CAS和动脉样性心血管疾病之间的共同和独特的遗传结构.
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