通过加权基因共同表达网络分析确定与大鼠热应激相关的关键基因
Fan Zhang1, Jinhuan Dou2, Xiuxin Zhao1
1College of Animal Science and Technology, China Agricultural University, Beijing 100193, China.
Animals : an open access journal from MDPI
|May 27, 2023
概括
全球变暖导致动物的热应激. 这项研究确定了关键基因,包括Parp2,Mettl3和Zfp36l1,参与调节大鼠对热应激的分子反应.
科学领域:
- 生理学 生理学 生理学
- 分子生物学分子生物学
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 全球变暖给动物的生存和健康带来了重大挑战,原因是热应激.
- 热应激反应背后的精确分子机制仍然不完全理解.
研究的目的:
- 阐明参与大鼠热应激反应的分子过程.
- 为了确定由热应激调节的关键基因和途径.
主要方法:
- 鼠被暴露在急性热应激 (42°C) 中,持续时间不同 (30,60,120分钟).
- 在上腺和肝脏组织上进行了RNA测序.
- 测量了上腺,肝脏和血液中的激素水平.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA) 用于识别与热应激相关的基因模块.
主要成果:
- 直肠温度和皮质水平与"黑色"模块 (富含热生成和RNA代谢) 中的基因有负相关性.
- "绿黄色"模块中的基因与直肠温度和上腺激素正相关,在压力下丰富转录调节.
- 关键基因包括甲基转移酶3 (Mettl3),聚ADP-ribose) 聚合酶2 (Parp2) 和指蛋白36样1 (Zfp36l1) 被确定为热应激调节中的关键基因.
结论:
- 确定了Parp2,Mettl3和Zfp36l1作为调节热应激反应的潜在候选基因.
- 这项研究为热应激的分子基础提供了新的见解.
- 了解这些分子通路可以为减轻热应激对动物健康不利影响的策略提供信息.
