先进的网络药理学研究揭示了Bacopa monnieri在肝癌中的多途径和多基因调节分子机制,基于数据挖掘,分子建模和微阵列数据分析
Muhammad Sadaqat1, Muhammad Qasim1, Muhammad Tahir Ul Qamar1
1Department of Bioinformatics and Biotechnology, Government College University Faisalabad (GCUF), Faisalabad, 38000, Pakistan.
巴科巴蒙尼耶里化合物通过向HSP90AA1和JUN.AA1等关键基因,显示出对抗肝癌的潜力. 需要进一步的研究来确认其治疗的有效性和安全性.
科学领域:
- 植物化学 植物化学
- 网络药理学 网络药理学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 肝癌通常是由病毒性乙型或乙型肝炎引起的,这对治疗提出了重大挑战.
- 自然产品,包括来自Bacopa monnieri (B. monnieri) 的产品,在历史上在癌症治疗方面表现有前途.
- 在B. monnieri对抗肝癌的有效性背后的精确分子机制在很大程度上仍未被发现.
研究的目的:
- 为了确定B. monnieri的有效植物化学物质用于肝癌治疗.
- 通过综合计算方法阐明B.monnieri在肝癌中的分子机制.
- 探索肝癌的潜在诊断和预后生物标志物.
主要方法:
- 对B. monnieri活性成分和肝癌点的数据挖掘.
- 网络药理学用于构建蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI) 网络并识别枢纽基因.
- 基因本体学 (GO) 和KEGG通路分析,微阵列数据分析 (GSE39791,GSE76427,GSE22058,GSE87630,GSE112790).
- 使用GEPIA和Pyrx软件进行分子对接和生存分析.
主要成果:
- 鉴定了素,黄素,原素,甲素,表素,标杆醇,β-醇,醇和乙酸作为关键的B. monnieri化合物,向TP53,IL6,AKT1,CASP3,TNF,JUN,HSP90AA1,VEGFA,EGFR和SRC等基因.
- 微阵列分析显示了上调的JUN和IL6,以及下调的HSP90AA1.
- 卡普兰-梅尔生存分析确定HSP90AA1和JUN作为潜在的诊断和预后生物标志物.
- 分子对接和动态模拟证实了化合物与HSP90AA1/JUN.之间强烈的结合亲和关系.
结论:
- B. monnieri 含有植物化学物质,可以通过特定的分子通路抑制肝癌的生长.
- HSP90AA1和JUN被确定为肝癌诊断和预后的有前途的生物标志物.
- 进一步的体外和体内研究对于验证B. monnieri在肝癌治疗中的治疗潜力和安全性至关重要.
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