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Updated: Jul 17, 2026
08:40
Methyl-binding DNA capture Sequencing for Patient Tissues
Published on: October 31, 2016
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全基因组DNA甲基化分析HPV阴性白血病和牙复合癌症的基因组
Mayuri Inchanalkar1,2, Sumana Srivatsa3,4, Srikant Ambatipudi1,5
1Mahimkar Lab, Cancer Research Institute (CRI), Advanced Centre for Treatment, Research and Education in Cancer (ACTREC), Tata Memorial Center, Kharghar, Navi Mumbai, Maharashtra, 410210, India.
Clinical epigenetics
|May 27, 2023
概括
在口腔致癌过程中,DNA甲基化模式发生显著的变化,从先发性白血病到牙口腔复杂状细胞癌 (GBC-OSCC). 这些发现揭示了GBC-OSCC.早期检测和预后的潜在生物标志物.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 表观遗传学 在表观遗传学中,表观遗传学是指表观遗传学.
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 淋巴瘤复杂口腔状细胞癌 (GBC-OSCC) 是一种侵袭性癌症,往往先于白血病.
- 已知基因组驱动因素,但口腔致癌阶段的DNA甲基化模式需要进一步阐明.
研究的目的:
- 在正常的口腔组织,白血病和GBC-OSCC.中调查全基因组DNA甲基化概况.
- 确定用于早期检测和预后的新生物标志物GBC-OSCC.
主要方法:
- 对22个正常,22个白血病和74个GBC-OSCC样本的全基因组DNA甲基化分析.
- 基因组,表观基因组和转录基因组数据的综合分析.
- 在独立的队列中使用双硫酸盐热测序对候选基因的验证.
主要成果:
- 与正常组织相比,在白血病和GBC-OSCC中观察到明显的DNA甲基化概况.
- 异常的DNA甲基化逐渐增加,从先发性病变到癌瘤.
- 在白血病中鉴定了846个差异甲基化促进体,5111个在GBC-OSCC中,具有共同的变化.
- 验证了8种新的候选生物标志物 (例如GLDC,HOXB13,FAT1) 和30个之前报告的基因.
结论:
- 甲基化特征与白血病和GBC-OSCC有关.
- 综合性分析确定了GBC-OSCC.的假定生物标志物.
- 这些生物标志物可能有助于GBC-OSCC的风险分层和预后.
