从小鼠心脏原始细胞中隔离核,以单细胞分辨率进行表观基因组和基因表达特征分析

科学领域:

• 心血管生物学心血管生物学
• 基因组学就是基因组学.
• 表观基因组学是指表观基因组学.

背景情况:

• 发育中的心脏包括由复杂的机制调节的多样化的祖细胞.
• 单细胞测序揭示了心脏原始细胞的异质性,但仅限于新鲜组织.
• 目前的方法需要立即处理新鲜组织,限制实验灵活性和增加变异性.

研究的目的:

• 开发一种灵活和可访问的协议,用于分析心脏原生细胞.
• 为了从冷样本中进行双奥米克 (snRNA-seq和snATAC-seq) 分析.
• 克服与加工新鲜心脏组织相关的局限性.

主要方法:

• 一种用于从冷的心脏前代细胞中快速隔离细胞核的新方案.
• 整合单核RNA测序 (snRNA-seq) 和高通量测序 (snATAC-seq) 的转化酶可访问色素的单核测定.
• 与微流体室平台的兼容性,用于简化分析.

主要成果:

• 从冷的心脏原生细胞样本中成功分离了细胞核.
• 证明该协议对结合snRNA-seq和snATAC-seq的实用性.
• 促进灵活的实验设计和降低技术变化.

结论:

• 提出的协议为心脏原生细胞研究提供了重大进展.
• 能够从冷样本中进行强大的双电力分析,提高研究灵活性.
• 为研究心脏发育和疾病机制提供了有价值的工具.