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Updated: Jul 28, 2025
03:36
Development of Compendium for Esophageal Squamous Cell Carcinoma
Published on: April 12, 2024
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通过转录组分析,识别预后枢纽基因和治疗缺乏症子模型中的治疗标
Lakshman Kumar Lingamgunta1, Bindu Prasuna Aloor2, Sreenivasulu Dasari3
1Department of Biochemistry, Sri Venkateswara University, Tirupati, 517502, Andhra Pradesh, India. laxman.lingam@gmail.com.
Scientific reports
|May 29, 2023
概括
缺乏会显著改变的基因表达,影响信号转导和细胞运动. 已识别的枢纽基因可能作为这种广泛的营养问题的生物标志物.
科学领域:
- 营养生物化学 营养生物化学
- 分子生物学分子生物学
- 动物科学动物科学
背景情况:
- 缺乏是全球性的健康问题.
- 了解其分子机制对于公共健康至关重要.
- 可以作为研究营养缺陷的相关模型.
研究的目的:
- 为了阐明缺乏的分子机制.
- 为了确定受缺乏影响的关键基因和途径.
- 探索潜在的生物标志物和治疗点.
主要方法:
- 采用了一种分为对照组和缺组的模型.
- 测量了血中的水平.
- 在卵巢样本上进行了转录组分析,以识别差异表达基因 (DEG).
- 使用生物信息学工具 (Cytoscape,CancerGeneNet) 进行途径和枢纽基因分析.
主要成果:
- 缺乏症显著降低了血水平.
- 确定了10,266个差异表达基因 (DEG).
- DEGs主要参与信号转导和细胞运动,并注意到GTPase调节活性.
- 凯格路径分析强调了参与信号转导路径的情况.
- 确定了8个模块和10个枢纽基因 (FRK,JUN,PTPRC,ACTA2,MST1R,SDC4,SDC1,CXCL12,MX1,EZR) 与受体氨酸激酶,Wnt和mTOR信号相关.
- 这些途径可能与癌症的发展有关.
结论:
- 缺乏严重影响基因表达,特别是在信号通路.
- 已识别的枢纽基因代表缺乏症的潜在诊断和预后生物标志物.
- 这些基因也可能作为治疗相关疾病的目标,在动物和人类.
