通过例行基因组类型识别突出扩展谱β-lactamase产生的Klebsiella肺炎疫情
F Gravey1,2, S Wilson3, A Denisenko4
1Univ de Caen Normandie, Univ Rouen Normandie, INSERM DYNAMICURE UMR 1311, CHU Caen, Caen, France.
Heliyon
|May 30, 2023
概括
常规的全基因组测序发现了一种罕见的,扩展频谱的β-乳糖酶产生的Klebsiella pneumoniae ST584疫情. 这种方法在两个重症监护病房成功调查和控制了四个月的流行病.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染病流行病学 传染病流行病学
背景情况:
- 全基因组测序 (WGS) 是微生物研究的既定标准.
- 预期和例行WGS实施为疫情检测提供了增强的能力.
研究的目的:
- 为了调查和控制由扩展光谱β-乳糖酶产生的Klebsiella pneumoniae ST584菌株引起的罕见流行病.
- 为了证明常规全基因组测序在检测和管理医院获得的感染的实用性.
主要方法:
- 预期和常规的全基因组测序Klebsiella pneumoniae分离物.
- 在两个重症监护病房爆发疫情的流行病学调查.
- 菌株特征,包括抗微生物耐药性概况.
主要成果:
- 发现了一种罕见的流行病菌株:Klebsiella pneumoniae ST584.
- 在两个重症监护病房检测到未申报的疫情.
- 在4个月的时间内成功制ESBL产生的Klebsiella pneumoniae ST584流行病.
结论:
- 常规的全基因组测序对于检测和控制罕见的微生物爆发是有效的.
- 这项研究成功地管理了一个具有挑战性的ESBL产生的Klebsiella pneumoniae ST584流行病.
- 基因组监测对于防止抗微生物耐药性病原体在医疗环境中的传播至关重要.
