在Campylobacter患者中,原生虫腹的诊断显著增加了分子技术的显著增加
David T S Hayman1, Juan Carlos Garcia-Ramirez1, Anthony Pita1
1Massey University, Palmerston North, New Zealand.
PLOS global public health
|May 30, 2023
概括
分子方法揭示了Cryptosporidium和Giardia在Campylobacter患者的诊断不足. 基于抗原的测定错过了重要的原生虫共感染,可能低估了疾病的影响.
科学领域:
- 医学微生物学 医学微生物学
- 传染性疾病 传染性疾病
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 菌和Giardia是全球腹的重要原因,并且在新西兰经常报告传染病.
- 目前的诊断方法,主要是基于抗原和显微镜的技术,正在被更敏感的分子方法所取代.
- 坎比洛巴克菌感染很常见,与其他肠道原生动物的共同感染可能会被标准诊断方法遗漏.
研究的目的:
- 评估Cryptosporidium和Giardia在Campylobacter病例中的患病率,这些病例最初是基于抗原的测试遗漏的.
- 为了比较不同分子测试协议的有效性,包括内部PCR和商业qPCR.
- 评估分子方法在疫情和常规监测期间检测原生动物共感染的性能.
主要方法:
- 进行了两项观察性研究:一项是在坎皮洛巴克特疫情期间进行的 (n=111) 和另一项是在例行监测期间进行的 (n=158).
- 使用内部终点PCR的分子检测,针对Cryptosporidium (gp60) 和Giardia (gdh) 的特定基因.
- 通过对阳性样本的连续稀释,评估了DNA提取方法 (带/不带珠子) 和与商业实时定量PCR (qPCR) 的比较.
主要成果:
- 在Campylobacter爆发患者中,Cryptosporidium和Giardia分别在9%和21%的患者中检测到.
- 在例行监测中,Cryptosporidium的患病率为40%,而Campylobacter阳性,抗原阴性样本中Giardia的患病率为1.3%.
- 在PCR方法 (含/不含珠) 或在内部PCR和qPCR之间没有观察到显著差异,这表明对分子分析的高灵敏度.
结论:
- 基于抗原的诊断试验显著低于诊断Cryptosporidium和Giardia联合感染在患有Campylobacter的患者中.
- 分子方法可以更准确地评估原生动物的共感染,这表明它们的影响可能被低估了.
- 改进的分子诊断策略对于对肠道感染的全面监测和管理至关重要.
