在视神经受伤后新生小鼠的视网膜转录组
Shi-Qi Yao1,2, Meng Wang1,2, Jia-Jian Liang1
1Joint Shantou International Eye Center of Shantou University and The Chinese University of Hong Kong, Shantou, Guangdong, China.
PloS one
|May 30, 2023
概括
哺乳动物的轴突再生在出生后是有限的. 这项研究使用RNA测序来识别影响轴突生长能力和光神经损伤后再生的关键基因.
科学领域:
- 神经科学是一个神经科学.
- 基因组学就是基因组学.
- 发展生物学 发展生物学
背景情况:
- 视网膜质细胞的轴突生长能力在出生后显著下降.
- 哺乳动物受伤后的轴突再生严重受限,特别是在成熟动物中.
研究的目的:
- 确定与轴突生长能力改变相关的转录组变化.
- 使用RNA测序 (RNA-Seq) 识别参与轴突再生的关键基因.
主要方法:
- 从胚胎日 (E) 20,产后日 (P) 1和P3小鼠的视网膜的RNA测序 (RNA-Seq).
- 使用K-平均分析识别和分类差异表达基因 (DEGs).
- 功能性丰富分析 (GO,KEGG,GSEA) 和通过定量实时聚合酶链反应 (qRT-PCR) 验证关键基因.
主要成果:
- 在新生小鼠视网膜中,根据年龄确定了5408个DEG,在ONC后确定了2639个DEG.
- 途径分析揭示了视觉感知,光传导,断裂修复,神经元投射指导和免疫系统途径的丰富.
- 鉴定了与轴突相关的集群中的枢纽基因,并验证了Mlc1,Zfp296,Atoh7,Ecel1,Creb5,Fosb和Lcn2的表达.
结论:
- 这项研究提供了在胚胎和新生儿小鼠视觉神经受伤后的第一个全面的基因表达数据.
- 这些发现为了解轴突生长能力因年龄和损伤而发生的变化提供了宝贵的资源.
- 已识别的基因和通路为增强轴突再生提供了潜在的目标.
