在使用3D OrbiSIMSS的生物膜中识别Pseudomonas aeruginosa外聚糖 Psl
Heba Khateb1,2, Andrew L Hook1, Stefanie Kern3
1Advanced Materials and Healthcare Technologies Division, School of Pharmacy, University of Nottingham, Nottingham, United Kingdom.
Biointerphases
|May 31, 2023
概括
这项研究使用3D OrbiSIMS进行无标签的多糖类的质谱测量,如 Pseudomonas aeruginosa 生物膜中的 Psl. 它成功地在生物膜中识别了PSL碎片,进步了现场分子分析.
科学领域:
- 生物物理化学 生物物理化学
- 分析化学 分析化学
- 微生物学 微生物学
背景情况:
- 多糖是质谱学的具有挑战性的分析剂.
- 二次离子质谱 (SIMS) 允许直接在现场分析,并保留样品的3D位置.
- 来自Pseudomonas aeruginosa的PSL外聚糖对生物膜形成至关重要.
研究的目的:
- 为PSL开发一种无标签的质谱法.
- 使用3D OrbiSIMS来准确地分配PSL的二次离子.
- 在P. aeruginosa生物膜中识别PSL碎片.
主要方法:
- 使用3D OrbiSIMS与OrbiTrap分析仪实现高质量分辨能力.
- 分析纯化的PSL和一个P. aeruginosa生物膜.
- 使用互补的中性损失序列来识别寡糖片段.
主要成果:
- 成功确定了17个峰值,可靠地分配到生物膜矩阵中的PSL片段.
- 证明了PSL的无标签质谱学.
- 验证了3D OrbiSIMS用于现场多糖体分析的使用.
结论:
- 3D OrbiSIMS 在PSL的无标签质谱学中是有效的.
- 这种方法可以在复杂的生物矩阵中准确识别PSL碎片.
- 该方法可以在现场分析诸如多糖类等具有挑战性的生物分子.
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