在人口中预测的致病性PATL2基因突变的高载体频率:基于生物信息学的方法
Hao Zhou1, Ye-Lan Cai2, Qing Luo2
1Faculty of Science, The University of Sydney, Sydney, NSW, Australia.
Frontiers in genetics
|May 31, 2023
概括
这项研究分析了影响卵细胞成熟的PATL2基因突变. 生物信息学揭示了比以前想象的更高的载体频率,突出了潜在的生育威胁,并告知了遗传咨询.
科学领域:
- 遗传学 是一个遗传学.
- 生物信息学是一种生物信息学.
- 生殖生物学 生殖生物学
背景情况:
- 托波二聚合酶II同源2 (PATL2) 对于卵细胞成熟至关重要.
- 关于PATL2突变的等位基因分布和载体频率的数据有限.
研究的目的:
- 为了对PATL2突变进行生物信息学分析.
- 为了确定致病性PATL2突变的等位基因分布和载体频率.
- 研究PATL2突变对卵细胞成熟和胚胎发育的影响.
主要方法:
- 使用结果数据和SNP数据库对PATL2突变进行生物信息学分析.
- 使用gnomAD和ExAC数据库进行载波频率估计.
- 使用AlphaFold来预测3D蛋白质结构的变化.
主要成果:
- 确定了大约53个致病性PATL2突变部位.
- 预计致病突变的载体频率至少为1.14‰ (1/877).
- 突变c.223-14_223-2del13显示的频率最高 (0.25‰),并构成生育风险.
- 具有PATL2突变的卵细胞在不同阶段 (GV,MI,第一个极体) 被捕获,导致受精失败和胚胎停止.
- 在突变部位预测的蛋白质结构异常与功能损失相关.
结论:
- 生物信息学分析揭示了PATL2突变的显著载体频率,比以前估计的要高.
- PATL2突变破坏了卵细胞成熟和胚胎发育,表型变异与蛋白质功能和结构有关.
- 这些发现为遗传咨询和与卵细胞成熟缺陷相关的药物研究提供了分子流行病学的基础.
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