改进crAssphage检测/量化方法及其在食品安全方面的广泛应用
So-Young Lee1, Jihye Yang2,3,4, Ju-Hoon Lee2,3,4,5
1Department of Food Science and Biotechnology, Institute of Life Sciences and Resources, Kyung Hee University, Yongin, Republic of Korea.
Frontiers in microbiology
|May 31, 2023
概括
现在可以使用新开发的qPCR方法快速检测人类特有的病毒crAssphage. 这一进步有助于识别水和食品中的人类便污染,改善公共卫生监测.
科学领域:
- 环境微生物学 环境微生物学
- 公共卫生 公共卫生
- 分子诊断学 分子诊断学
背景情况:
- 水传染病源于便-口腔病原体的传播.
- 像大肠杆菌和肠球菌这样的传统指标无法区分人类和动物便来源.
- 仅在人类肠道中发现的crAssphage是人类便污染的有希望的指标.
研究的目的:
- 开发和评估快速定量实时PCR (qPCR) 方法,用于检测人类菌体.
- 评估用于crAssphage检测的新型原料/探头组合的特异性和灵敏性.
- 在各种矩阵中验证crAssphage作为人类便污染指标的实用性.
主要方法:
- 收集了139个人类和89个动物便样本.
- 使用了三种现有的和两种新开发的原料/探针组合来检测菌体的qPCR检测.
- 分析了污水和模拟受污染的食品样本.
主要成果:
- 新开发的CrAssPFL2原料/探针组合在人体样本中显示出最高的检测率 (30.9%) 和最低的检测极限 (436.16份).
- crAssphage仅在人类样本中检测到,证实了其对人类的特异性.
- 污水样本显示了高crAssphage污染 (平均10^5.71副本/毫升),食品样本可检测到10^7.55副本.
结论:
- 优化的qPCR测定,特别是使用CrAssPFL2组合,可使敏感和特定的检测人类crAssphage.
- 该方法有效地识别环境和食品样本中的人类便污染源.
- crAssphage qPCR为公共卫生监测和水质监测提供了一个有价值的工具.
