基于LC-MS的尿液非向的代谢学分析,以识别和细分泌腺癌
Ming Yang1, Xiaoyan Liu2, Xiaoyue Tang2
1Department of Urology, Peking Union Medical College Hospital, Chinese Academy of Medical Science, Peking Union Medical College, Beijing, China.
Frontiers in oncology
|May 31, 2023
概括
尿液代谢学有效地区分尿道癌 (UC) 和健康对照,并区分上道癌 (UTUC) 和下道癌 (BCa). 这种方法有助于识别潜在的癌症生物标志物和异常基因.
科学领域:
- 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科 泌尿器科
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 尿代谢学表明,作为尿路癌 (UC) 的非侵入性液体活检有希望.
- 区分上道泌尿道癌 (UTUC),膀癌 (BCa) 和健康对照 (HCs) 需要确定特定的生物标志物.
研究的目的:
- 为了识别差异性泌尿代谢物,以区分UC和HC.
- 为了区分UTUC和BCa,有和没有血.
- 探索将尿液代谢学与转录学相结合的实用性,以识别BCa.中的异常基因.
主要方法:
- 来自35个UTUC,44个BCa和53个HC的尿样使用液态染色学高分辨率质谱法 (LC-HRMS) 进行分析.
- 在不同组中确定了不同的代谢物和代谢途径.
- 转录组学数据与代谢组学集成,以确定潜在的与疾病相关的基因.
主要成果:
- 一个由四种代谢物组成的小组区分了UC和HC,其AUC为0.815 (验证AUC=0.845).
- 不同的代谢物面板将UTUC与BCa无血区分开来 (AUC=0.858) 和UTUC与BCa有血区分开来 (AUC=0.83).
- 包括脂肪酸生物合成和纯素代谢在内的代谢途径在UC中受到失调. PTGIS和BCHE基因表达与BCa存活相关.
结论:
- LC-HRMS尿液代谢学可以有效地区分UC和HC,并区分UTUC和BCa.
- 结合尿液代谢学和转录学可以揭示潜在的异常代谢基因.
- 这种方法为UC生物标志物发现和亚型化提供了一个有希望的策略.
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