在人类血液样本中寻找植物微RNA:生物信息学证据和前景
Lorenzo Olmi1, Gerardo Pepe1, Manuela Helmer-Citterich1
1Dept. Biology, University of Rome Tor Vergata, Via della Ricerca Scientifica 1, Rome, 00133, Italy.
概括
这项研究使用严格的生物信息学方法研究了人类血液中的植物微RNA (pmiRNA). 结果表明pmiRNAs存在,并可能影响人类的神经发生,通过饮食支持跨王国调节 (CKR).
科学领域:
- 分子生物学分子生物学
- 遗传学 是一个遗传学.
- 营养科学 营养科学
背景情况:
- 跨王国调节 (CKR) 的概念提出,食用植物的microRNAs可以进入人类血流并调节基因表达.
- 人体循环中的植物microRNAs (pmiRNAs) 的存在和机制由于先前的研究中对方法的担忧而备受争议.
研究的目的:
- 通过严格的生物信息学方法,研究人类血液中pmiRNAs的存在.
- 为了确定人类系统中检测到的pmiRNAs的潜在生物功能.
- 为了解决之前的CKR研究中对控制和数据分析的批评.
主要方法:
- 来自5个下一代测序 (NGS) 项目380个实验的小RNA测序数据的分析.
- 应用严格的过和控制条件来识别真正的pmiRNAs.
- 对已识别的pmiRNAs的人类mRNA目标的生物信息预测.
主要成果:
- 在多个NGS项目中检测了人体血中的350个循环pmiRNAs.
- 预计已识别的pmiRNA将向主要参与神经发生和神经系统发育的人类mRNA.
- 一个NGS项目的结果由于样本可能受到污染而令人怀疑,但其他项目提供了可靠的证据.
结论:
- 这项研究提供了强有力的生物信息学证据,支持人体血液中pmiRNAs的存在,可能通过饮食获得.
- 鉴定到的pmiRNAs可能在人类的神经过程中发挥作用,这表明CKR的功能方面.
- 需要进一步的研究来澄清人体循环中的pmiRNAs的稳定性和精确机制,但这些发现支持CKR假设.
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