皮肤肌炎相关的肝细胞癌的风险预测
Xusheng Zhang1, Yongxin Ma1, Kejun Liu1,2,3
1Ningxia Medical University, Yinchuan, 750004, China.
BMC bioinformatics
|May 31, 2023
概括
五个皮肤肌炎特征基因 (LY6E,IFITM1,GADD45A,MT1M,SPP1) 显示出早期肝细胞癌 (HCC) 检测的生物标志物的潜力. 通过PI3K/ART途径,SPP1可能促进HCC.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 皮肤肌肉炎 (DM) 是一种异常性炎症性肌肉病.
- 肝细胞癌 (HCC) 是一种主要的肝脏恶性瘤.
- 在DM患者中确定HCC的早期生物标志物至关重要.
研究的目的:
- 确定皮肤肌肉炎 (DM) 签名基因作为肝细胞癌 (HCC) 的潜在生物标志物.
- 阐明DM基因与HCC的关联背后的分子机制.
- 开发一个预测模型,用于DM患者的HCC风险.
主要方法:
- 在mRNA-Seq数据上使用LASSO回归和支持矢量机 (SVM) 选五个DM特征基因.
- 构建和评估HCC的诺米克风险预测模型.
- 使用CIBERSORT和ssGSEA分析瘤免疫微环境和HCCC中的免疫检查点表达.
主要成果:
- 五个DM特征基因 (LY6E,IFITM1,GADD45A,MT1M,SPP1) 在具有诊断潜力的HCC中表现出明显改变的表达.
- 开发的诺莫格拉姆模型证明了对HCC风险的良好预测效果.
- 提高SPP1的调节与通过整体蛋白激活PI3K/ART通路有关,这可能导致HCC的进展.
结论:
- LY6E,IFITM1,GADD45A,MT1M和SPP1是DM患者新发性HCC的有希望的预测目标.
- SPP1/整蛋白/PI3K/ART轴代表了HCC的潜在治疗标.
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