代谢学峰值分析计算工具 (MPACT):一种用于代谢学和复杂生物样本中的分子数据可视化的高级信息学工具
Robert M Samples1,2, Sara P Puckett1, Marcy J Balunas1,3,4
1Division of Medicinal Chemistry, Department of Pharmaceutical Sciences, University of Connecticut, Storrs, Connecticut 06269, United States.
Analytical chemistry
|June 1, 2023
概括
一个新的计算工具 Metabolomics Peak Analysis Computational Tool (MPACT) 通过改进数据过和优先级来增强非目标代谢学. MPACT有助于发现微生物的天然产品,例如Streptomyces的新型硫化化合物.
科学领域:
- 代谢学 代谢学 代谢学
- 计算生物学 计算生物学
- 自然产品 化学 化学
背景情况:
- 未定位的代谢学产生了大量数据集,具有许多不信息的特征.
- 目前用于代谢学数据的优先级工具通常是低效的.
- 复杂的生物样本需要先进的过和优先级方法.
研究的目的:
- 引入代谢学峰值分析计算工具 (MPACT),这是一个用于质谱数据分析的新平台.
- 提高分析非目标代谢学数据的效率和有效性.
- 为了证明MPACT在发现微生物天然产品中的实用性.
主要方法:
- MPACT采用多模式过,先进的统计技术与多层次复制,以及交互式可视化.
- 该平台用于分析稀土元素对Streptomyces sp.的影响. PTY087I2.2. 这是一个很大的问题.
- 数据分析的重点是识别和描述二次代谢物.
主要成果:
- MPACT成功地发现了暴露对Streptomyces的隐性影响.
- 描述了两种硫化化合物,包括一种新的囊蛋白衍生物,花素C.
- 此外,Granaticin D (mycothiogranaticin A) 也被确定,验证了MPACT的发现能力.
结论:
- MPACT是一种有效的平台,用于分析非目标代谢学数据,特别是用于微生物天然产品的发现.
- 该工具的适应性扩展到各种应用,包括生物标志物检测和环境小分子分析.
- MPACT促进了复杂化学相互作用的发现和新型化合物的发现.
