使用MultiABLERER进行非目标代谢和脂质组数据的综合处理

科学领域:

• 生物医学研究生物医学研究
• 生物信息学是一种生物信息学.
• 分析化学 分析化学

背景情况:

• 在生物医学研究中,非向的代谢学和脂质学方法至关重要.
• 整合多原子数据,包括蛋白质组学,代谢组学和脂质组学,至关重要.
• 现有的软件缺乏统一的管道来处理同时生成的代谢和脂质组数据.

研究的目的:

• 介绍MultiABLER,一个统一的R管道,用于前期处理和分析代谢学和脂质学数据.
• 促进多原子数据集的联合下游分析.
• 为研究人员提供准备使用的生物信息学解决方案.

主要方法:

• 开发一个名为MultiABLER的R管道.
• 使用液体染色学-并联质谱法 (LC-MS/MS) 来获取数据.
• 处理非目标代谢和脂质组数据集.

主要成果:

• MultiABLER提供了一个统一而简单的上游处理和分析管道.
• 该管道是为代谢学和脂质学数据集设计的.
• 在开源许可证下提供R代码.

结论:

• MultiABLER解决了对代谢学和脂质学统一生物信息学管道的需求.
• 该管道支持将代谢和脂质组数据集成到多组学研究中.
• 该工具增强了基于质谱的方法在生物医学研究中的实用性.