综合转录组分析和机器学习揭示了PCOS和复发性植入失败之间的共享诊断基因和潜在机制
Wenhui Chen1,2,3, Qingling Yang1,2,3, Linli Hu1,2,3
1Center for Reproductive Medicine, The First Affiliated Hospital of Zhengzhou University, Zhengzhou, China.
Frontiers in immunology
|June 1, 2023
概括
多囊性卵巢综合征 (PCOS) 和复发性植入失败 (RIF) 具有共同的免疫和代谢障碍. GLIPR1和MAMLD1被确定为这两种疾病的关键诊断基因.
科学领域:
- 生殖内分泌学 生殖内分泌学
- 基因组学就是基因组学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
背景情况:
- 多囊卵巢综合征 (PCOS) 影响5-10%的生育年龄妇女,其特点是内分泌和代谢功能障碍.
- 在PCOS中改变的子宫内膜免疫细胞有助于慢性炎症和复发性植入失败 (RIF).
研究的目的:
- 在PCOS和RIF中识别共享的分子机制和诊断基因.
- 探索代谢干扰和免疫细胞激活在同时发生的PCOS和RIF之间的相互作用.
主要方法:
- 来自基因表达综合 (GEO) 数据库的PCOS和RIF数据集的分析.
- 权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),功能丰富和机器学习算法.
- 使用RT-PCR和ROC曲线分析对诊断基因 (GLIPR1,MAMLD1) 的验证.
主要成果:
- 确定了十二个共享基因和两个诊断基因 (GLIPR1,MAMLD1) 针对PCOS和RIF.
- 确认了高AUC值的GLIPR1和MAMLD1的诊断潜力.
- 在PCOS和RIF患者中发现了TCA循环代谢障碍和免疫细胞激活.
结论:
- GLIPR1和MAMLD1是诊断PCOS和RIF的潜在生物标志物.
- 共享的代谢失调,特别是在TCA循环中,是通过免疫细胞激活PCOS和RIF的共同发生的基础.
