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Updated: Jul 28, 2025
08:04
Pancreatic Tissue Dissection to Isolate Viable Single Cells
Published on: May 26, 2023
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用NanoString技术对EUS-FNA样本中的胰腺腺癌的向转录组分析
L Pedrosa1, I K Araujo1,2, M Cuatrecasas1,3,4
1Institut d'Investigacions Biomèdiques August Pi i Sunyer (IDIBAPS), Barcelona, Spain.
Frontiers in molecular biosciences
|June 2, 2023
概括
对于胰腺管腺癌 (PDAC) 的分子分析,可进行内镜超声波引导细针吸收 (EUS-FNA) 样本的转录组纳米字符串 (NanoString) 分析. 虽然免疫生物标志物在EUS-FNA样本中富含,但癌症相关纤维细胞等 stromal 标志物不足.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 基因组学就是基因组学.
- 胃肠病学 胃肠病学
背景情况:
- 精确的瘤学要求对胰腺管腺癌 (PDAC) 样本进行转录组分析.
- 在PDAC诊断中,内镜超声波引导细针吸收 (EUS-FNA) 是至关重要的.
- 该NanoString平台使得从有限的RNA产量中实现转录组分析.
研究的目的:
- 评估在EUS-FNA样本中针对PDAC的转录组纳米字符串分析的可行性.
- 为了比较EUS-FNA和外科切除样本之间的转录组形状.
- 评估EUS-FNA衍生的PDAC样本中树皮和免疫生物标志物的表现.
主要方法:
- 包括18名接受EUS-FNA和手术切除的PDAC患者.
- 用52基因NanoString面板在甲固定,嵌入 (FFPE) 细胞学和手术样本上进行RNA提取和转录组分析.
- 在FFPE标本中细胞类型丰度的量化和相关性.
主要成果:
- 在EUS-FNA和手术样本之间观察到不同的基因表达.
- 手术样本显示了丰富的癌症相关纤维细胞 (CAF) 和上皮-介质细胞过渡 (EMT) 档案.
- 在EUS-FNA样本中,免疫生物标志物的代表性更大.
- 细胞学检查证实,与手术样本相比,EUS-FNA样本中的CAF丰度较低,免疫细胞存在较高.
结论:
- 通过EUS-FNA对PDAC的向转录组纳米字符串分析是一个可行的手术前分子分析方法.
- 流体CAF/EMTmRNA生物标志物在EUS-FNA样本中表现不足.
- 该方法提供了在手术前对PDAC分子特征的见解.
