开发一个带有36个插入/删除标记 (InDel) 的多重面板,用于个人识别
Gonul Filoglu1, Arzu Duvenci1, Sebahat Tas1
1Institute of Forensic Science and Legal Medicine, Istanbul University- Cerrahpasa, 34500, Istanbul, Turkey.
Forensic science, medicine, and pathology
|June 2, 2023
概括
开发了一个新的36个插入/删除 (InDel) 复合面板,用于人类识别. 这种基因标记系统表现出高灵敏度和准确性,使其适用于法医遗传学和人口研究.
科学领域:
- 法医遗传学 法医遗传学
- 人口遗传学 人口遗传学
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 插入/删除 (InDel) 多态是法医遗传学中越来越受欢迎的遗传标记.
- 它们的低突变率和小片大小比传统标记物具有优势.
- 需要一个强大的InDel小组来进行人类识别和人口研究.
研究的目的:
- 开发和验证一个36-InDelplex识别面板.
- 为了确定土耳其人口中面板的基因频率.
- 评估该小组是否适合用于人类鉴定和种群遗传学.
主要方法:
- 一个36个InDelplex面板的开发 (34个自体的InDel位点,1个Y的InDel位点,阿梅洛金).
- 从1000个基因组项目第3期数据中选择位点,MAF≥0.4.4.
- 根据SWGDAM指南进行验证,包括灵敏度,可复制性和抑制剂耐受性.
- 在250个土耳其样本上进行人口研究,并与全球主要人口进行比较.
主要成果:
- 开发的面板显示出高灵敏度,产生了0.25 ng DNA的完整配置文件.
- 土耳其人口研究显示,平均观察到的异构性 (Ho) 为0.48.
- 该小组获得了0.999999999990867的组合歧视能力 (CPD) 和0.9930.30的组合排除概率 (CPE).
结论:
- 36-InDelplex面板是一个可靠,灵敏和准确的人类识别系统.
- 该面板非常适合人口遗传学研究,包括法医应用.
- 该系统为土耳其人口提供了有价值的遗传数据,并有助于进行全球人口比较.
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