转录空间-时间映射识别了协调的免疫和树皮细胞模式以及伤口愈合和癌症中的基因程序

科学领域:

• 发展生物学 发展生物学
• 细胞生物学 细胞生物学
• 系统生物学 系统生物学

背景情况:

• 组织修复是一个复杂的,协调的过程,涉及多种细胞类型的空间和时间.
• 目前还没有全面了解单细胞层面的这种协调.

研究的目的:

• 在皮肤伤口关闭期间描述单细胞转录状态,以了解细胞协调.
• 识别和定义代表跨细胞类型协调基因表达模式的多细胞"运动".
• 为了研究这些伤口愈合运动在瘤发育中的保存.

主要方法:

• 单细胞RNA测序以捕捉皮肤伤口关闭期间的转录状态.
• 对基因表达特征的分析,以确定时空模式和多细胞运动.
• 清除伤口的大体成像用于验证和预测细胞细胞通信 (发送者/接收者基因程序).

主要成果:

• 在皮肤伤口关闭过程中揭示了编排的转录状态和基因表达特征.
• 在多种细胞类型中确定了所谓的多细胞"运动"的共享时空模式.
• 在小鼠和人类瘤模型中发现了保存的伤口愈合运动,这表明伤口愈合和癌症之间存在联系.

结论:

• 多细胞"运动"代表了组织生物学的基本单元,协调伤口愈合中的细胞反应.
• 瘤可能代表'永远不会愈合的伤口',与组织修复过程共享保存的多细胞动态.
• 这一框架为组织生物学和疾病的综合研究提供了基础.