在人体食纤维干预研究中,精选和协调了肠道微生物组16SrRNA片数据
Cynthia I Rodriguez1, Ali Keshavarzian2, Bruce R Hamaker3
1Dept. of Ecology and Evolutionary Biology, University of California, Irvine, USA. cirodri1@uci.edu.
Scientific data
|June 2, 2023
概括
这项研究提供了来自11项纤维干预研究的可访问,精选的微生物组数据. 此资源有助于研究食纤维如何影响肠道微生物群和人类健康.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 营养科学 营养科学
背景情况:
- 人类微生物组研究通过下一代测序产生大量数据.
- 微生物组数据和元数据的可访问性和标准化对于科学复制性和发现至关重要.
- 食纤维摄入量与健康益处有关,可能由肠道微生物群的组成和功能介导.
研究的目的:
- 创建一个统一的,可访问的数据集,用于比较肠道微生物群对食纤维干预措施的反应.
- 为了方便在多项研究中进行直接比较,调查纤维对肠道微生物群的影响.
- 提高微生物组研究的可重复使用性和可重复性.
主要方法:
- 从11个不同的纤维干预研究中收集了16S rRNA测序数据和相关元数据.
- 在策划数据集中包括了总共2,368个人类样本.
- 处理和标准化遗传数据和元数据,以实现跨研究的可比性.
主要成果:
- 一个全面的数据集16S rRNA基因序列和11个纤维干预研究的元数据现在可用.
- 该数据集包括2,368个样本,为微生物组研究提供了大量资源.
- 精选和预处理的数据可以直接比较肠道微生物组的变化,以应对食纤维.
结论:
- 精心策划的数据集显著提高了在不同纤维干预研究中比较肠道微生物群反应的能力.
- 该资源促进了可复制性,并促进了饮食和微生物群相互作用领域的新发现.
- 标准化对微生物组数据的访问对于提高我们对肠道健康和纤维作用的理解至关重要.
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