基于下一代测序的哈普洛型链接分析在生殖前基因检测中对生殖线马赛克的临床应用
Dongjia Chen1,2, Yan Xu1,2, Yu Fu3
1The First Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, Guangzhou, 510080, China.
Orphanet journal of rare diseases
|June 3, 2023
概括
下一代测序 (NGS) 有效地使生殖前遗传测试 (PGT) 能够用于生殖线马赛克. 与传统的PCR方法相比,这种NGS-SNP方法为单一性疾病提供了更高的诊断准确性.
科学领域:
- 生殖遗传学 生殖遗传学
- 基因组学就是基因组学.
- 分子生物学分子生物学
背景情况:
- 使用聚合酶链反应 (PCR) 和短串重复 (STR) 进行单基因疾病 (PGT-M) 传统的植入前遗传检测受到可用的标记物数量和复杂优化的限制.
- 设计PCR探头和优化多重PCR的反应条件是耗时和劳动密集的过程.
研究的目的:
- 评估基于下一代测序 (NGS) 的哈普罗型链接分析在生殖前遗传测试 (PGT) 时的有效性.
- 为了比较NGS-SNP方法的诊断准确性与基于PCR的PGT-M传统方法.
主要方法:
- 使用基于NGS的PGT-M单元型链接分析,对两种患有杜氏肌肉发育不良 (DMD) 或TSC1突变的生殖系马赛克的家族进行了PGT-M分析.
- 从九个芽细胞体中进行了托菲克托德姆活检,使用多重位移放大 (MDA) 分析,随后进行NGS和桑格测序以检测特定突变.
- 通过NGS识别与突变相关的单核酸多态 (SNP) 位点,用于单核型链接分析,以及基于NGS的形形查.
主要成果:
- 所有九个囊胚都产生了明确的PGT结果,使得胚胎移植成功.
- 两个家庭都实现了临床怀孕,产前诊断证实了基因型正常和euploid胎儿.
- 在PGT中,NGS-SNP方法在生殖线马赛克中表现出有效性.
结论:
- NGS-SNP分析是生殖前遗传检测的有效方法,用于生殖前的生殖线马赛克病例.
- 由于信息多态标记的数量较多,NGS-SNP方法提供了比PCR方法更高的诊断准确度.
- 需要进一步的研究来证实基于NGS的PGT在没有幸存下来的后代可供分析时,对生殖线马赛克的疗效.
