开发一种基于机器学习的签名,利用炎症反应基因来预测卵巢癌的预后和免疫微环境
Li Dong1, Ya-Ping Qian1, Shu-Xiu Li1
1Department of Obstetrics and Gynaecology, Changzhou Geriatric Hospital Affiliated to Soochow University, Changzhou, No. 7 People's Hospital, Changzhou, China.
Open medicine (Warsaw, Poland)
|June 5, 2023
概括
与炎症相关的基因 (IRRG) 影响卵巢癌 (OC) 亚型. 亚型B,具有高免疫透率和Treg细胞,预后不佳,突出显示IRRGs.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 卵巢癌 (OC) 是一个严重的健康挑战,预后不佳.
- 与炎症相关的因素与OC的发展有关,但特定的炎症反应相关基因 (IRRGs) 的作用尚不清楚.
研究的目的:
- 调查IRRG在OC发展和预后中的作用.
- 根据炎症反应分类OC亚型并确定预后生物标志物.
主要方法:
- 综合了来自7个队伍的mRNA表达特征,并进行了单变Cox回归来选26个IRRG.
- 将OC患者根据IRRG分类为亚型,并分析免疫细胞透和生物通路.
- 采用机器学习算法来预测存活率,并使用全幻灯片成像和体外实验验证实结果.
主要成果:
- 鉴定了具有明显炎症特征的OC亚型;亚型B显示显著的免疫透和Treg细胞丰富,与免疫抑制和不良预后相关.
- 经过验证的树皮细胞,炎症细胞和瘤细胞分布,并阐明了亚型之间的途径激活差异.
- 确定CXCL10是关键的预后性IRRG,由巨细胞分泌,并参与瘤淋巴血管生成.
结论:
- IRRGs在OC病变和患者预后方面发挥着重要作用.
- OC亚型表现出多样化的炎症情景,影响免疫反应和生存.
- 因此,CXCL10成为卵巢癌的潜在治疗点.
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