在骨髓瘤中开发和验证与氧化压力相关的预后特征:分子实验和生物信息学的结合
Bin Xie1, Shiyong Tan1, Chao Li1
1Second Department of Spinal Surgery, Weihaiwei People's Hospital, Weihai, Shandong 264200, P.R. China.
Oncology letters
|June 5, 2023
概括
这项研究确定了五种与氧化压力相关的基因 (CAT,MAPK1,G6PD,MAP3K5,CCL2),这些基因可以预测骨髓瘤 (OS) 的预后. 较高的风险分数表明较差的结果和瘤微环境的改变,其中MAP3K5起着关键作用.
科学领域:
- 在瘤学瘤学.
- 分子生物学分子生物学
- 生物信息学是一种生物信息学.
背景情况:
- 骨肉瘤 (OS) 是一种流行恶性瘤,预后不佳.
- 氧化应激与各种癌症有关,包括OS.
- 确定可靠的预后标志物对于OS患者管理至关重要.
研究的目的:
- 开发和验证一种与氧化压力相关的基因特征,用于预测OS预后.
- 调查风险得分,瘤微环境和OS中的免疫透之间的相关性.
- 阐明关键基因,特别是MAP3K5在OS进展中的功能作用.
主要方法:
- 利用了癌症基因组图谱和基因表达总汇数据集.
- 应用了最小绝对收缩和选择运算符 (LASSO) 回归和Cox回归来构建签名.
- 使用接收器操作特征 (ROC) 曲线和卡普兰-梅尔生存分析验证了签名.
- 评估瘤微环境得分和免疫透水平.
- 进行了分子实验来研究MAP3K5功能.
主要成果:
- 一个五个基因签名 (CAT,MAPK1,G6PD,MAP3K5,CCL2) 被确定为OS预后的独立预测因素.
- 来自签名的更高风险得分与更差的预后相关,瘤纯度增加,免疫透率降低.
- 一个名图有效预测了OS患者的3年和5年生存率.
- 在OS和骨质细胞细胞系之间观察到特征基因的差异表达.
- 发现MAP3K5可以抑制增殖和运动,促进亡,并诱导OS细胞中的活性氧物种.
结论:
- 开发的与氧化压力相关的基因特征作为预测OS预后的强大工具.
- 签名及其相关的风险评分有可能成为OS的新生物标志物.
- 这些发现提供了关于氧化应激和OS瘤微环境之间的相互作用的见解,建议新的治疗途径.
