基于多重PCR的下一代测序是一种新,有针对性和准确的分子方法,用于诊断周围假肢关节感染
Changyu Huang1,2,3, Ying Huang1,2,3, Ziwen Wang4
1Department of Orthopaedic Surgery, National Regional Medical Center, Binhai Campus of the First Affiliated Hospital, Fujian Medical University, Fuzhou, China.
Frontiers in microbiology
|June 5, 2023
概括
针对性下一代测序 (tNGS) 能够有效地识别周围假肢关节感染 (PJI) 的病原体,并检测药物耐药性基因. 与元基因组测序相比,这种方法提供更快的周转时间和更低的成本,使其成为一种有价值的诊断工具.
科学领域:
- 微生物学 微生物学
- 基因组学就是基因组学.
- 传染性疾病 传染性疾病
背景情况:
- 周围假肢关节感染 (PJI) 诊断具有挑战性,病原体的识别至关重要.
- 目前PJI的诊断方法在速度和全面的病原体检测方面存在局限性.
研究的目的:
- 评估目标下一代测序 (tNGS) 在检测PJI中的病原体方面的有效性.
- 为了比较tNGS与元遗传NGS (mNGS) 和传统培养方法的一致性.
- 评估tNGS在PJI病原体中识别抗菌素耐药性基因的能力.
主要方法:
- 分析了患有和没有PJI的患者,以及负控制组.
- 使用培养,mNGS和tNGS检测到微生物.
- 对比了这些方法的诊断敏感性和特异性.
- 使用tNGS检测药物耐药性基因,并评估了成本效益.
主要成果:
- tNGS在PJI诊断方面表现出高灵敏度 (88.37%) 和特异性 (95.24%),与mNGS和培养相比较.
- tNGS在37.5%的培养阳性PJI中发现了耐药基因.
- 与mNGS相比,tNGS的交付时间显著缩短 (14.5小时而不是28小时),成本更低 (150美元而不是260美元).
结论:
- tNGS是识别PJI病原体的有效工具,可以提供关键的耐药性信息.
- 在PJI诊断的成本和周转时间方面,tNGS比mNGS具有优势.
- 建议采用综合多种技术的多学科方法,以实现最佳的PJI诊断.
