病毒样RNA-依赖RNA聚合酶编码的两病毒在复杂的真菌中很丰富
Li Chuin Chong1, Chris Lauber1
1Institute for Experimental Virology, TWINCORE Centre for Experimental and Clinical Infection Research, a Joint Venture Between the Hannover Medical School (MHH) and the Helmholtz Centre for Infection Research (HZI), Hannover, Germany.
这项研究在真菌生物体内发现了超过2500种新型的两病毒,一种传染病原体. 这些发现揭示了庞大的,尚未探索的多样性,特别是在Basidiomycota真菌,并显示没有证据的人类微生物组.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 菌类学 菌类学是指菌类学.
- 基因组学就是基因组学.
背景情况:
- 两病毒是具有RNA病毒和病毒性特征的混合传染元件.
- 它们是假设的真菌病原体,但大多数已识别的基因组来自metatranscriptomes.
研究的目的:
- 在真菌转录组中进行全面的两病毒查.
- 描述真菌王国内的两病毒的多样性和进化起源.
主要方法:
- 从序列读取档案 (SRA) 选了超过46,500个真菌转录组.
- 采用数据驱动的病毒发现方法.
- 分析了蛋白质序列的身份,以识别新的双病毒成员.
主要成果:
- 在真菌中识别了超过2500个双病毒序列,在Basidiomycota.有显著的扩张.
- 发现了一种高度多样化的未知的两病毒,其中一些只有27%的蛋白质序列与已知的亲属相同.
- 通过转基因组查,没有发现人类微生物组中存在双病毒的证据.
结论:
- 揭示了真菌中以前未知的两病毒的大量多样性.
- 提供了对两病毒作为RNA基因组传染病原体的演变的新见解.
- 根据现有的数据,证实了人类微生物组中没有两病毒.
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