通过机器学习和光学连贯性断层扫描在2型糖尿病中对3D伤口形态的自动量化量化
Yinhai Wang1, Adrian Freeman2, Ramzi Ajjan3
1Data Sciences & Quantitative Biology Discovery Sciences BioPharmaceuticals R&D AstraZeneca Cambridge UK.
Skin health and disease
|June 5, 2023
概括
自动3D光学连贯断层扫描 (OCT) 通过细分组织形态来量化伤口愈合. 这种机器学习方法提供了一种灵敏的实时方法来监测伤口的修复和发展.
科学领域:
- 生物医学工程 生物医学工程
- 医疗成像医学成像
- 伤口治愈研究研究 伤口治愈研究
背景情况:
- 每年有数以百万计的人遭受伤害,这种伤害因2型糖尿病和人口老龄化而加剧.
- 伤口愈合障碍与11β-hydroxysteroid脱酶1型 (11β-HSD1) 的葡萄糖皮质体激活有关.
- 之前的研究表明,AZD4017 (一种11β-HSD1抑制剂) 通过手动2D OCT改善了急性伤口愈合,但这种方法是主观的和劳动密集的.
研究的目的:
- 开发一种自动化的3D OCT方法,用于快速识别和量化伤口形态.
- 为了实现伤口愈合过程的客观,高通量分析.
主要方法:
- 训练了一个u-net深度学习模型,将3D OCT扫描细分为四个关键的伤口形态:早期颗粒组织,晚期颗粒组织,新表皮和血栓.
- 该模型分析了 204 个来自穿孔活检的 3D OCT 扫描 (24,480 个 2D ).
- 自动细分用于比较伤口后的第2天和第7天的组织面积和体积,比较AZD4017治疗与安慰剂.
主要成果:
- 自动化OCT成功区分和量化伤口组织形态,跟踪它们在愈合过程中的体积变化.
- 自动化方法的结果与手动OCT测量结果相关联.
- 治疗AZD4017的趋势是新表皮体积增加,这与通过手动OCT观察到的改善的再表皮化相一致.
结论:
- 机器学习与OCT相结合,提供了一种自动化,非侵入性,实时的方法来量化伤口愈合.
- 这种方法代表了伤口愈合研究的重大进步,特别是对于慢性伤口.
- 开发的方法是灵敏的,可重复的,适合未来的临床应用.
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