对人类子宫内膜的转录学研究进行的系统审查显示,不一致报告的差异性表达基因不一致
Evangeline R Walker1, Mollie McGrane2, John D Aplin3
1E Walker, Reproductive Medicine, Central Manchester NHS Trust, Manchester , United Kingdom of Great Britain and Northern Ireland.
Reproduction & fertility
|June 5, 2023
概括
对74项子宫内膜转录学研究的系统审查揭示了参与者细节和病理学变量定义的不一致报告. 大多数报告的差异表达基因 (DEGs) 不推进生物机制的识别.
科学领域:
- 生殖生物学和基因组学.
- 分子和细胞生物学分子和细胞生物学
- 生物信息学和系统生物学
背景情况:
- 全基因组基因表达分析对于理解子宫内膜功能至关重要.
- 之前对子宫内膜转录组学的系统审查缺乏.
- 子宫内膜研究包括月经周期,病理学和激素治疗背景.
研究的目的:
- 系统地审查和分析现有的子宫内膜转录学研究.
- 识别文献中的共同主题,不一致性和局限性.
- 评估报告的差异表达基因 (DEGs) 的可比性和生物相关性.
主要方法:
- 确定了74项报告全子宫内膜转录组的研究.
- 研究的分类为月经周期,病理学和激素治疗组.
- 在五个子类别中对差异表达基因 (DEG) 的比较.
主要成果:
- 参与者的关键信息 (周期长度,BMI) 和生育状况通常没有报告.
- 对于复发性植入失败 (RIF) 等病理的定义是可变的.
- 只有两个子类别产生了一致的DEG,少量 (<40) 富含发育和免疫过程.
结论:
- 不一致的人口统计数据,生育定义和激素治疗阻碍了对子宫内膜转录学研究的比较.
- 大多数报告的DEGs并不有助于识别潜在的生物机制.
- 未来的研究应该纳入网络生物学和实验验证,以获得强大的基因表达特征.
