在葡萄藤化中的适应性和不适应性侵入.
Hua Xiao1,2, Zhongjie Liu1, Nan Wang1
1State Key Laboratory of Tropical Crop Breeding, Shenzhen Branch, Guangdong Laboratory of Lingnan Modern Agriculture, Key Laboratory of Synthetic Biology, Ministry of Agriculture and Rural Affairs, Agricultural Genomics Institute at Shenzhen, Chinese Academy of Agricultural Sciences, Shenzhen 518000, China.
野生欧洲葡萄 (EU) 连续与栽培葡萄交配了2000年,改善了味道,但增加了遗传负载. 这种基因组入侵为葡萄藤育种提供了洞察力.
科学领域:
- 基因组学就是基因组学.
- 人口遗传学 人口遗传学
- 植物育种 植物育种
背景情况:
- 葡萄树 (Vitis vinifera) 在欧洲化了大约3000年前.
- 之前的研究表明野生到培养基因流动,但缺乏关于时间,机制和影响的细节.
研究的目的:
- 调查野生和栽培欧洲葡萄之间的内侵的时间线,模式,基因组模式和生物学后果.
- 确定受内侵和选择影响的遗传区域和途径.
主要方法:
- 分析了345个野生和栽培葡萄样本的复序数据.
- 基于机器学习的人口遗传分析.
- 人口历史和选择签名的推断.
主要成果:
- 证据表明,在野生欧洲 (欧盟) 和栽培葡萄之间,主要是从欧盟到葡萄酒之间,有一个单一的化事件,然后是持续的基因流动 (约2000年).
- 软选择性扫描主导了人工选择信号.
- 丰富了内进和选定的地区的芳香化合物合成途径,表明野生葡萄对风味的贡献.
- 内向性增加了有害的遗传负载,主要是在异卵性状态下.
结论:
- 野生欧洲葡萄是通过适应性内进来增强栽培葡萄风味的重要资源.
- 虽然有好处,但内进也带来了重大的遗传负担.
- 了解这些有益和有害的影响对于未来葡萄树的基因组育种策略至关重要.
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