转录学和系统基于网络的分子机制的草药配方Huosu-Yangwei抑制胃癌 in vivo

科学领域:

• 在瘤学瘤学.
• 分子生物学分子生物学
• 生物信息学是一种生物信息学.

背景情况:

• 黄苏阳威 (HSYW) 在治疗晚期胃癌和癌前病变方面表现出有效性.
• 对于HSYW抗胃瘤作用的精确分子机制尚不清楚.

研究的目的:

• 阐明HSYW在胃癌治疗中的分子机制.
• 使用转录学和生物信息学探索受HSYW影响的circRNA-miRNA-mRNA调节网络.

主要方法:

• 在体内动物模型被用来评估HSYW的抗瘤作用.
• 通过RNA测序确定了差异表达的circRNA和mRNA.
• 构建circRNA-miRNA-mRNA和蛋白质-蛋白质相互作用网络.
• 使用qRT-PCR验证网络,并分析TCGA/HPA数据库.

主要成果:

• 在小鼠模型中,HSYW显著抑制了瘤生长.
• 转录组分析显示了119个差异表达的circRNA和200个差异表达的mRNA.
• 一个核心circRNA-miRNA-mRNA网络确定了潜在的生物标志物:4个circRNA,5个miRNA和6个mRNA.
• 在胃癌和正常样本之间,KLF15和PREX1mRNA水平显著不同.

结论:

• 这项研究确定了两个关键通路:circRNA_00240/hsa-miR-642a-5p/KLF15和circRNA_07980/hsa-miR-766-3p/PREX1.
• 这些途径对于HSYW对胃癌的治疗作用至关重要.
• 已识别的circRNAs,miRNAs和mRNAs作为HSYW治疗疗效的潜在生物标志物.