结晶结构的确定,分子对接和分子动力学阿里拉尔二元作为潜在的抑制剂,割抗性前列腺癌

科学领域:

• 生物化学 生物化学
• 分子生物学分子生物学
• 药用化学 医学化学

背景情况:

• 阴道抗性前列腺癌 (CRPC) 的特征是增加雄激素受体 (AR) 信号,由内雄激素产生和AR放大驱动.
• 阿尔多基托减少酶家族1成员C3 (AKR1C3) 在CRPC上调节,并从前体分子中合成强大的AR配体.

研究的目的:

• 使用X射线晶体学研究AKR1C3连接体的晶体结构.
• 通过分子对接和动态模拟来评估合成的分子作为潜在的AKR1C3抑制剂.

主要方法:

• 用X射线结晶学来确定连接体结构.
• 分子对接和分子动力学模拟以评估结合亲和力.
• MM-PBSA计算量化结合能量的计算方法.

主要成果:

• 合成的抑制剂对AKR1C3.3.具有显著的结合能量.
• 抑制剂 2,2'-((4-甲基) 甲) bis(3,4-基-5,5-二甲基环-2-en-1-one) 的结合能量为-132.456 kJ/mol.
• 抑制剂 2,2'-(甲) bis(3-基-5,5-二甲基环-2--1-one) 的结合能量为 -81.017 kJ/mol.

结论:

• 这项研究为CRPC针对AKR1C3.3.提供了一种有希望的药物设计方法.
• 基于受体位合适而不是结构类比的药物设计是一个可行的策略.