在消除后阶段的麻疹分子监测中,MF非编码区域的实用性,西班牙,2017-2020年
Camille Jacqueline1,2, Ana María Gavilán1,3, Noemí López-Perea3,4
1Centro Nacional de Microbiología, Instituto de Salud Carlos III, Majadahonda, Majadahonda, Spain.
Frontiers in microbiology
|June 7, 2023
概括
对麻疹病毒N基因 (N450) 的分析不足以跟踪传播. 使用MF-NCR区域可以加强疫情分析,识别西班牙的同时进口和较小的传播链.
科学领域:
- 病毒学 病毒学
- 流行病学 流行病学
- 遗传学 是一个遗传学.
背景情况:
- 标准麻疹病毒测序 (N450) 在消除后的环境中努力追踪传播链.
- 在2017-2020年期间,西班牙的大多数麻疹序列是B3-都柏林或D8-Gir Somnath变体.
- 对麻疹病毒非编码区域 (MF-NCR) 进行了评估,以改善分子监测.
研究的目的:
- 评估MF-NCR区域对提高麻疹传播链分辨率的有用性.
- 改善麻疹疫情的特征和推断病例起源.
- 为了区分麻疹病毒的单个和多个引入事件.
主要方法:
- 115个MF-NCR区域从西班牙麻疹菌株 (B3-都柏林和D8-Gir Somnath变种) 的测序.
- 进行了流行病学,家族遗传学和家族动力学分析.
- 应用了数学模型来评估已识别的类别之间的相关性.
主要成果:
- 多种植物 - - 红河国家公园地区有助于确定由多个同时进口而产生的基因组,而不仅仅是单一的传播链.
- 在一次疫情中发现了两个相关的分类,这表明有两个不同的传播链.
- 分析表明,仅基于N450数据,疫情规模比之前估计的要小.
结论:
- 在MF-NCR地区显著改善了同步麻疹进口的识别,帮助接触者追踪.
- 调查结果支持西班牙 (2017-2020年) 没有流行性麻疹传播.
- 结合N450测序的MF-NCR区域被推用于未来的世卫组织麻疹监测指南.
