高通量单细胞蛋白质分析器官衍生异质细胞群通过纳米流双陷单列液态染色学
Simion Kreimer1,2, Aleksandra Binek1,2, Blandine Chazarin1,2
1Advanced Clinical Biosystems Research Institute, Smidt Heart Institute, Cedars-Sinai Medical Center, Los Angeles, California 90048, United States.
Analytical chemistry
|June 8, 2023
概括
这项研究引入了并行纳米流双陷单列液态染色学 (nanoDTSC) 用于单细胞的快速蛋白质组分析. 这种高通量方法有效地识别复杂混合物中的罕见细胞类型.
科学领域:
- 蛋白质组学是指蛋白质组学.
- 细胞生物学 细胞生物学
- 分析化学 分析化学
- 质谱测量质量谱测量
背景情况:
- 在复杂的生物样本中分析罕见细胞类型需要高通量方法.
- 无标签的定量质谱法是细胞蛋白质特征的关键技术.
- 现有的方法可能缺乏对单细胞综合分析所需的速度和效率.
研究的目的:
- 开发一种可访问和高效的液态染色学 (LC) 解决方案,用于高通量单细胞蛋白质组分析.
- 为了能够在复杂的混合物中识别和表征罕见细胞群.
- 证明在单个细胞和异质细胞群中量化蛋白质的能力.
主要方法:
- 实现并行纳米流双陷单列液态染色法 (纳米DTSC).
- 优化LC条件,使每个单元的总运行时间为15分钟.
- 使用商业标准组件,以提高可访问性和可重复性.
- 在11.5分钟窗口内对的量化.
主要成果:
- 实现了每天分析96个单细胞的吞吐量.
- 在个体心肌细胞中成功量化了1000多种蛋白质.
- 在来自大动脉的异质单细胞群体中特征蛋白质表达.
结论:
- 纳米DTSC系统为高通量单细胞蛋白质组学提供了高效和可访问的LC解决方案.
- 这种方法显著提高了识别和表征罕见细胞类型的能力.
- 该技术适用于各种生物样本,包括复杂的器官衍生细胞混合物.
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