使用QSP模型生成免疫基因组数据引导的虚拟患者,以预测晚期NSCLC对PD-L1抑制的反应
Hanwen Wang1, Theinmozhi Arulraj2, Holly Kimko3
1Department of Biomedical Engineering, Johns Hopkins University School of Medicine, Baltimore, MD, 21205, USA. hwang163@jhmi.edu.
NPJ precision oncology
|June 8, 2023
概括
使用定量系统药理 (QSP) 模型生成虚拟患者有助于免疫瘤学研究. 这项研究成功预测了非小细胞肺癌 (NSCLC) 中对PD-L1抑制的临床反应.
科学领域:
- 计算生物学 计算生物学
- 免疫学 免疫学 免疫学
- 药理学 药理学是指药理学的学科.
背景情况:
- 量化系统药理 (QSP) 模型对于理解药物开发中的复杂生物系统至关重要.
- 从有限的数据中生成现实的虚拟患者在免疫瘤学中是一个重大挑战.
- 以前的癌症免疫循环的QSP模型需要适应特定的癌症类型,如非小细胞肺癌 (NSCLC).
研究的目的:
- 参数化NSCLC癌症免疫周期的QSP模型.
- 为预测对PD-L1抑制的临床反应生成虚拟患者队列.
- 评估免疫基因组和药物动力学数据在虚拟患者生成中的有用性.
主要方法:
- 参数化了以前发表的癌症免疫循环的QSP模型,以NSCLC.
- 使用来自iAtlas门户的免疫基因组数据生成了一个虚拟患者队列.
- 纳入了PD-L1抑制剂杜尔瓦卢马布 (durvalumab) 的种群药动力学数据.
主要成果:
- 该QSP模型预测,在虚拟NSCLC患者中,PD-L1抑制的响应率为18.6%.
- 确定了CD8/Treg比率作为潜在的预测生物标志物,除了PD-L1表达和瘤突变负担之外.
- 在免疫瘤学中证明了omics数据用于虚拟患者生成的可靠性.
结论:
- 用现实数据参数化的QSP模型可以有效地生成虚拟患者队列,用于药物反应预测.
- 在免疫瘤学中,Omics数据是推进虚拟患者生成技术的宝贵资源.
- 该研究强调了CD8/Treg比率作为NSCLC中PD-L1抑制治疗的预测生物标志物的潜力.
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