自动计数Drosophila影像盘细胞核的自动计数
Pablo Sanchez Bosch1, Jeffrey D Axelrod1
1Department of Pathology, Stanford University School of Medicine, Stanford, CA 94305, USA.
bioRxiv : the preprint server for biology
|June 9, 2023
概括
研究人员为密集的组织开发了自动化的细胞计数工作流程,例如果翅膀的发育. 这种方法增强了图像分析和发育生物学研究中的统计能力.
科学领域:
- 发展生物学 发展生物学
- 图像分析 图像分析
- 计算生物学 计算生物学
背景情况:
- 自动化图像量化具有先进的图像分析和统计能力.
- 果 (Drosophila melanogaster) 翅膀在发育过程中,由于细胞密度高,因此对细胞计数提出了挑战.
- 现有的工作流程在密集组织中难以有效地计数细胞.
研究的目的:
- 提供高效的自动细胞计数工作流程,用于量化果发展中的细胞.
- 为了使图像磁盘的细胞计数准确,包括总细胞计数和标记的克隆.
主要方法:
- 在高密度组织中开发用于细胞细分和计数的自动化工作流程.
- 训练一种机器学习算法,用于细分和计数双点标记的细胞核,区分异和同细胞.
- 应用结构不可知的工作流程,只需要核标签.
主要成果:
- 成功实施自动化工作流程,用于量化果翅膀中的细胞.
- 精确计数总细胞和光标记的克隆细胞内的细胞在影像盘中.
- 开发一种机器学习方法来挑战双点标签分析.
结论:
- 介绍了一个新的,高效的,可适应的自动化细胞计数解决方案,用于发育生物学.
- 便于在密集的生物结构中对细胞群的高通量分析.
- 有潜力显著推进发育生物学和相关领域的研究.


