基于机器学习的斯坦福A型大动脉剖析中识别铁亡相关的生物标志物
Hao Pan1, Wei Lu2, Zhifei Liu1
1Department of Anesthesiology, Shandong Provincial Hospital Affiliated to Shandong First Medical University Jinan, Shandong, China.
American journal of translational research
|June 12, 2023
概括
研究人员确定DAZAP1和GABARAPL2是斯坦福A型大动脉剖析 (STAAD) 的潜在生物标志物. 这些与铁亡相关的基因可能为STAAD和其他癌症提供新的治疗策略.
科学领域:
- 生物医学研究的研究.
- 心血管科学 心血管科学
- 在瘤学瘤学.
背景情况:
- 斯坦福A型大动脉剖析 (STAAD) 是一种具有高死亡率的危急心血管疾病.
- 铁亡是一种受调节的细胞死亡形式,与各种疾病有关,但其在STAAD中的具体作用仍未确定.
研究的目的:
- 为了研究铁死在STAAD进展中的作用.
- 为了确定与铁亡相关的基因作为STAAD的潜在诊断生物标志物.
- 探索基于铁亡的STAAD的治疗策略.
主要方法:
- 使用的基因表达数据集 (GSE52093,GSE98770,GSE153434) 来自基因表达综合 (GEO) 数据库.
- 应用权重基因共同表达网络分析 (WGCNA),LASSO和SVM-RFE,以确定关键的铁亡相关基因.
- 进行了接收器操作特征 (ROC) 曲线分析,免疫细胞透分析 (CIBERSORT) 和药物敏感性分析 (CellMiner).
主要成果:
- 鉴定了65个与铁亡相关的基因,确定了DAZAP1和GABARAPL2作为STAAD的重要诊断生物标志物.
- 开发了一个可靠的nomogram用于STAAD诊断.
- 在STAAD中观察到单细胞透的增加,DAZAP1和GABARAPL2与单细胞的差异相关性.
- 发现DAZAP1,GABARAPL2和癌症预后之间的关联,表明潜在的治疗点.
结论:
- 作为STAAD的诊断生物标志物,DAZAP1和GABARAPL2显示出有希望的结果.
- 这些已识别的基因将铁灭,癌症和STAAD联系起来,为开发STAAD新的治疗方法提供了新的见解.
